主角有马拓也为一个无所事事的高中生,他父亲是历史学()家,却在研究时失踪,留下他与()继母两人相依为命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹,里面有一个罗()盘和三颗水晶珠(),以及一封写着「时间是可逆()的,历史是不可逆的」云云以及一些关于平行()世界概念的信,并交待主角晚()上去当地有()名的地标剑之岬去见一个人()。
拓也晚上如约来到剑之岬,发现自己的继()母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺()幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收到的邮包交出来,并拔出枪来威胁他,千钧一发之际,一道闪电落下劈在了神社()的御神()石上,拓也就此晕去。等拓也甦醒过来周围已经旁无一人,回家睡了一觉后才发现不对劲。继母和龙藏寺完()全不记得昨晚发生的事情,此时他才发现原来父亲()寄给他的遗物是可以让人在平行世界自由穿梭的神奇道具(),于是他为了找到父亲真正的下落展开了一系()列调查。